寡核苷酸和疏水性的分子結(jié)合形成的兩親性DNA在構(gòu)筑各種納米結(jié)構(gòu)方面有著廣闊的前景。多價效應(multivalency effects)帶來的分子識別性能非常值得研究。在水中,兩親性DNA往往會自組裝成具有機核心和DNA電暈的納米結(jié)構(gòu)。這些納米組裝體的分子識別性能(高結(jié)合常數(shù)、尖銳的熔融轉(zhuǎn)變、抗酶解性以及**細胞攝取)在基因檢測和基因**等生命醫(yī)學領域有著重要的應用前景。
兩親性分子的自組裝結(jié)構(gòu)通常可以通過改變親疏水部分的體積占比來控制。然而,由于DNA的磷酸鹽骨架結(jié)構(gòu)具有非常強的親水性,兩親性DNA往往只會簡單地組裝成球狀膠束,不容易像兩親性多肽那樣組裝成多種多樣的納米結(jié)構(gòu),比如具有周期性螺旋的圓柱納米纖維、具有層次組裝結(jié)構(gòu)的納米管和納米螺旋等。
圖1. 兩親性多肽(PA)的分子結(jié)構(gòu)及其在水中的多種自組裝納米形貌。
設計合成了同時含有多肽和DNA的雙生物活性嵌段共聚物DNA-b-poly (amino acid),實現(xiàn)了對兩親性生物大分子系統(tǒng)性和程序式的形貌控制,得到了具有多種自組裝形貌和分子識別性能的組裝體。
圖2. DNA-b-poly (amino acid)的合成過程
多肽鏈段poly (amino acid)的合成采用了可逆加成斷裂鏈轉(zhuǎn)移(Reversible Addition-Fragmentation Chain Transfer,RAFT)可控聚合,并結(jié)合了**的固相多肽合成(Solid-phase peptide synthesis,SPPS)。為了平衡強親水性的DNA鏈段,使用了具有強疏水側(cè)鏈的苯丙氨酸(Phe或F)作為多肽鏈段的單體。DNA鏈段和多肽鏈段經(jīng)過一步脫水縮合就得到了雙分子嵌段共聚物DNA-b-poly (amino acid)。合成了三種分子量和重復單元稍有不同的共聚物,其中多肽鏈段的分子量范圍是2800 g/mol-5700 g/mol,DNA鏈段含有21個堿基對。
苯丙氨酸聚合物通常會組裝成二維片層結(jié)構(gòu),不是纖維結(jié)構(gòu);如上所述,DNA組裝體通常只會形成簡單的球狀膠束。然而有趣的是,發(fā)現(xiàn)兩者的結(jié)合產(chǎn)物DNA-b-poly (amino acid)在水(含10% HFIP)中形成了完全不同的結(jié)構(gòu):一維納米纖維!所使用的溶液濃度極稀,只有1 μM;其中一種DNA-b-poly (amino acid)的臨界膠束濃度(critical micelle concentration,CMC)只有140 nM 。利用了透射電子顯微鏡(TEM)對納米纖維結(jié)構(gòu)進行了表征。
圖3. DNA-b-poly (amino acid)在HFIP和水混合溶劑中自組裝形成的一維納米纖維結(jié)構(gòu)。標尺:500 nm
由于溶劑對非共價作用影響很大,將混合溶液中10%的HFIP換成了另外四種有機溶劑(DMF、ACN、MeOH、2-propanol)重復了自組裝實驗,發(fā)現(xiàn)DNA-b-poly (amino acid)在這四種極性有機溶劑和水的混合溶劑中都組裝成了二維納米結(jié)構(gòu),而不再是一維的納米纖維。隨著溶劑極性的增加,共聚物的組裝結(jié)構(gòu)從納米纖維(HFIP)先變?yōu)檎{米條帶(2-propanol)后變?yōu)閷捈{米片層(DMF、ACN、MeOH)。這次,不僅利用了TEM還利用了熒光顯微鏡對標記了的共聚物形貌進行了表征。此外,還對可能的作用機制進行了推測。
圖4. DNA-b-poly (amino acid)在四種極性有機溶劑和水的混合溶劑中自組裝形成的二維納米條帶/片層結(jié)構(gòu)
兩親性大分子在以水為主的溶劑中自組裝時,一定會把疏水片段包裹在核心而將親水性片段暴露在外表,共聚物DNA-b-poly (amino acid)也應該不例外。盡管多肽鏈段和DNA鏈段在組裝體中的分布一般不會與上述基本規(guī)律相違背,沒有直觀的表征就說DNA是一定暴露在組裝體外表未免有些不夠嚴謹。因此,將與共聚物中DNA互補片段修飾的金納米顆粒與共聚物混合共組裝,通過TEM觀察發(fā)現(xiàn)得到了表面布滿金納米顆粒的DNA納米纖維,直觀地證明了DNA-b-poly (amino acid) 組裝結(jié)構(gòu)中DNA鏈段和多肽鏈段的分布。
圖5. 金納米顆粒DNA雜化共組裝
如果說雙生物活性共聚物DNA-b-poly (amino acid)是一個雙面手,而與金納米顆粒雜化顯跡是DNA這一面的特性,那么多肽這一面的特性該如何通過共聚物的自組裝結(jié)構(gòu)更好地體現(xiàn)呢?在DNA-b-poly (amino acid)中分別加入了胰凝乳蛋白酶(Chymotrypsin)和嗜熱菌素(thermolysin)兩種蛋白酶水解切割共聚物中多肽鏈段側(cè)鏈的端甲氧基或端苯丙氨酸基團,并通過TEM比較研究,發(fā)現(xiàn)同一共聚物序列在同一溶劑中的自組裝結(jié)構(gòu)會由納米纖維轉(zhuǎn)變成納米片層結(jié)構(gòu),實現(xiàn)了對DNA組裝體結(jié)構(gòu)的程序式控制。
圖6. 蛋白酶作用下DNA-b-poly (amino acid)組裝體納米結(jié)構(gòu)的轉(zhuǎn)變