核苷酸糖轉(zhuǎn)運體(NSTs)是ER和高爾基族的溶質(zhì)載體35 (SLC35)家族成員,通過將腔內(nèi)單磷酸核苷酸交換為胞質(zhì)核苷酸糖,為糖基化提供底物。NSTs缺陷已被證實與先天性糖基化(CDG)疾病有關(guān),然而,許多類型CDG的分子基礎(chǔ)仍不明確。為了更好地理解NSTs的生物學(xué)特性,我們確定了udp -半乳糖轉(zhuǎn)運體(SLC35A2)、udp - n -乙酰氨基葡萄糖轉(zhuǎn)運體(SLC35A3)和一個孤兒核苷酸糖轉(zhuǎn)運體SLC35A4的潛在相互作用伙伴。
為此,我們將每個SLC35A2-A4蛋白作為誘餌進行了四個獨立的下拉實驗,并用質(zhì)譜技術(shù)鑒定了免疫沉淀物質(zhì)。從獲得的候選名單中,我們選擇了一些使用納米比特系統(tǒng)(一種基于熒光素的分離發(fā)光技術(shù))在體外確認(rèn)相互作用的候選名單。NSTs與兩種atp酶(ATP2A2、ATP2C1)、高爾基pH調(diào)節(jié)因子B (GPR89B)和鈣通道(TMCO1)相互作用,這可能反映了離子穩(wěn)態(tài)對糖基化的調(diào)節(jié)作用,并與basigin (BSG)相互作用。
我們的發(fā)現(xiàn)為NST相互作用網(wǎng)絡(luò)的發(fā)現(xiàn)提供了一個起點,以便更好地理解糖基化是如何被調(diào)節(jié)并與其他細(xì)胞過程相聯(lián)系的。意義:盡管核苷酸糖轉(zhuǎn)運體是蛋白質(zhì)糖基化機制的關(guān)鍵組成部分,并且其缺乏活性是嚴(yán)重的代謝性疾病的基礎(chǔ),但這些必需蛋白質(zhì)的生物學(xué)、功能和調(diào)節(jié)仍是謎。
在本研究中,我們通過識別一組新的潛在的相互作用伙伴,用于udp -半乳糖轉(zhuǎn)運體(SLC35A2)、udp - n -乙酰氨基葡萄糖轉(zhuǎn)運體(SLC35A3)和一個孤兒轉(zhuǎn)運體SLC35A4,但其作用尚未確定。其中幾個新的相互作用通過NanoBiT系統(tǒng)在體外得到證實,這是一種分裂熒光素酶互補實驗。這項工作的意義還在于,它通過對4種不同的共免疫沉淀策略的詳細(xì)比較,以及定制的樣品制備和數(shù)據(jù)處理工作流程,解決了發(fā)現(xiàn)膜蛋白相互作用伙伴的總體挑戰(zhàn)。
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