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UDP 糖|抗生素合成UDP-glucuronate 4- epiimerase MoeE5與底物復合物的結構
發布時間:2021-12-31     作者:UDP 糖   分享到:

環孢鏈霉菌(Streptomyces viridosporus)的異丙基酶MoeE5將udp -葡萄糖醛酸(UDP-GlcA)轉化為udp -半乳糖醛酸(UDP-GalA),為合成莫尼霉素(moenomycin)提供了**個糖。

莫尼霉素是一種對細菌肽聚糖糖基轉移酶的****劑。

該酶屬于udp -己糖4-異丙基酶家族,以NAD+作為輔助因子。

本文報道了MoeE5/NAD+/UDP-GlcA和MoeE5/NAD+/UDP-glucose的復雜晶體結構,其分辨率分別為1.48??和1.66??。

輔因子NAD+與n端Rossmann-fold結構域結合,襯底與較小的c端結構域結合。

在這兩種晶體中,底物糖基部分的C4原子靠近NAD+的煙酰胺的C4原子,糖的O4原子也與Tyr154的側鏈氫鍵結合,表明了一種生產結合模式。

作為該蛋白家族中**個在活性位點上與UDP-GlcA結合的復雜結構,它在酶和底物之間顯示出廣泛的氫鍵網絡。

我們進一步用產物UDP-GalA建立模型,發現MoeE5中獨特的Arg192可能在催化過程中發揮重要作用。

因此,MoeE5可能是UDP-GlcA轉化為UDP-GalA的一種特異性異丙基酶,而不是像其他家族成員那樣是一種混雜酶。

1640224923(1).jpg

UDP-L-RhaNAcUDP-4n-D-FucNAc
UDP-D-XylNAcUDP-VioNAc
UDP-2-Biotinyl-GalNAcUDP-6-Biotinyl-GalNAc


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