核酸染料SYBR Green I
產(chǎn)品簡(jiǎn)介:
本品用DMSO溶解,因?yàn)镈MSO熔點(diǎn)是18.3℃,使用前請(qǐng)放置到室溫充分溶解。
操作步驟(僅供參考):
一、膠染法(用法通EB)( 推薦方法,見(jiàn)圖1)
1、制膠時(shí)加入SYBR Green I 核酸染料。冷卻膠到 50℃左右,每100ml膠中加入1-3μl
SYBR Green I核酸染料(見(jiàn)圖 1)。
2、按照常規(guī)方法進(jìn)行電泳即可。
3、用紫外凝膠透射儀或可見(jiàn)光透射儀觀測(cè)。藍(lán)光可透過(guò)玻璃,觀測(cè)聚丙烯酰胺凝膠時(shí),
可直接將托有凝膠的玻璃平皿放入可見(jiàn)光透射儀內(nèi)觀測(cè)。
需要注意的是:此方法染色能準(zhǔn)確確定片段分子量且用量較少。1ml 染料可以做 1000 塊10 ml 膠,每塊膠點(diǎn)50個(gè)樣,可做50000次。
二、點(diǎn)染法(見(jiàn)圖3)
1、該方法適于瓊脂糖凝膠電泳和PAGE凝膠電泳。
2、工作液的配制:用電泳緩沖液將10000×的SYBR Green I 稀釋100倍,即為SYBR Green
I 工作液。SYBR Green I 工作液可以置2~8℃保存一個(gè)月以上, 濃縮液在-20℃保存半年。
3、制膠:按常規(guī)方法制膠,不含任何染料。
4、樣品染色:向分析樣品中加入SYBR Green I 工作液和載樣緩沖液,室溫放置10分鐘,
使SYBR Green I 與樣品中DNA充分結(jié)合。SYBR Green I 工作液加入量為總上樣量的1/5~
1/10。
5、DNA Marker染色:將5μL DNA Marker、5μL DNA Marker稀釋液和1μL SYBR Green
I 工作液混勻,室溫放置5分鐘,使SYBR Green I 與DNA充分結(jié)合。
6、上樣、電泳:按常規(guī)操作。用紫外凝膠透射儀或可見(jiàn)光透射儀觀測(cè)。藍(lán)光可透過(guò)玻
璃,觀測(cè)聚丙烯酰胺凝膠時(shí),可直接將托有凝膠的玻璃平皿放入可見(jiàn)光透射儀內(nèi)觀測(cè)。
注意:用點(diǎn)染法染色時(shí),染料用量少。通常點(diǎn)一個(gè)樣加入 1μL 即可,可以
使用 10000 次, 但大片段稍有滯后現(xiàn)象,如果需要更準(zhǔn)確確定分子量(與Marker對(duì)比),建議使用膠染法。
三、泡染法
1、按照常規(guī)方法進(jìn)行制膠,其中不含任何染料。
2、用 pH 7.0 - 8.5 的緩沖液(如:TAE, TBE),按照 1﹕1000 的比例稀釋SYBR Green
I 核酸染料,混勻,制成染色溶液。
3、將染色溶液倒入合適的聚丙烯容器中,放入凝膠,用鋁箔等蓋住容器使染料避光。室
溫振蕩染色 10-30 分鐘,染色時(shí)間因凝膠濃度和厚度而定。聚丙烯酰胺凝膠直 接在玻璃平
皿上染色,將配好的稀釋溶液輕輕地倒在膠板上,讓稀釋液均勻地覆 蓋整個(gè)膠板,并染色 30
分鐘。玻璃平皿必須預(yù)先經(jīng)過(guò)硅烷化溶液處理(避免染料吸附在玻璃表面上)。
4、用紫外凝膠透射儀或可見(jiàn)光透射儀觀測(cè)。藍(lán)光可透過(guò)玻璃,觀測(cè)聚丙烯酰胺凝膠時(shí),
可直接將托有凝膠的玻璃平皿放入可見(jiàn)光透射儀內(nèi)觀測(cè)。
需要注意的是:用泡染方法染色時(shí),可以確定核酸片段分子量。但是三種方法中染料用量的。
幾種染色方法特點(diǎn)比較:
儲(chǔ)存條件:2-8℃避光干燥可保存24個(gè)月
注意事項(xiàng):
1、 Sybr Green 核酸染料樣品點(diǎn)染方法中,電泳不要超過(guò) 2 小時(shí),以免核酸染料從 DNA/RNA 上分離出來(lái),產(chǎn)生彌散狀條帶。
2、用點(diǎn)染方法染色時(shí),條帶稍有滯后現(xiàn)象,如果需要確定片段分子量(和 Marker 對(duì)比),建議用膠染法和泡染法。
3、常規(guī)用酒精沉淀核酸過(guò)程中,SYBR Green I 核酸染料可以全部從核酸上去掉。
4、DNA電泳請(qǐng)選擇SYBR Green I 染料,RNA 電泳請(qǐng)選擇SYBR Green II染料,兩種染料不通用。
5、SYBR Green I 核酸染料對(duì)玻璃和非聚丙烯材料具有一定親合力。建議在稀釋、貯存、染 色等使用過(guò)程中用聚丙烯類(lèi)容器。
可以加Orange Red 作為標(biāo)記. pH值在7.5-8.3之間,不要微波加熱,加入熱膠的溫度低于50度。
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以上內(nèi)容來(lái)自齊岳小編zzj 2021.5.18