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蘋果酸脫氫酶結(jié)構(gòu)分析
發(fā)布時間:2021-02-24     作者:zl   分享到:

  蘋果酸脫氫酶是同工酶家族的一員,不同來源的蘋果酸脫氫酶同工酶在一級序列上表現(xiàn)出很低的相似性,有時甚至不到20%。例如:E.coli MDH和豬心線粒體蘋果酸脫氫酶(mMDH)58%的序列是一致的,而與豬心胞質(zhì)蘋果酸脫氫酶(cMDH)20%的同源性。但在蛋白質(zhì)**結(jié)構(gòu)上,不同物種來源的MDH具有相似性,尤其在輔酶結(jié)合部位、催化活性位點及亞基結(jié)合作用的特殊部位,不同的MDH顯示了高度保守的氨基酸序列。

  對MDH結(jié)構(gòu)的研究始于1968年。經(jīng)過多年的研究總結(jié),eMDHcDNA編碼序列于1987年公布,蛋白質(zhì)分子的完整信息于1992年整理到了PDB 數(shù)據(jù)庫中(www.rcsb.org,1EMD),其氨基酸全序列如圖1

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1大腸桿菌蘋果酸脫氫酶氨基酸序列

  eMDHcDNA編碼條全長為312aa的肽鏈,翻譯后表達(dá)成為表觀分子量為32,500道爾頓的蛋白質(zhì)。eMDH一個亞基分子中含有三個半胱氨酸,分別為99位、113位、251(1-1中以陰影表示)。分子內(nèi)部無二硫鍵形成,其中有一個半胱氨酸位于催化活性腔內(nèi),它不直接參與催化但會對催化活性產(chǎn)生影響,它作為親核基團(tuán)可能參與輔酶的結(jié)合

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圖2 大腸桿菌蘋果酸脫氫酶亞基分子立體結(jié)構(gòu)

  圖2給出了eMDH的亞基分子的空間立體結(jié)構(gòu),它有兩個域,N-端是結(jié)合輔酶NAD*催化域,C-端是結(jié)合底物L-malate 的催化域。

  晶體結(jié)構(gòu)研究顯示,二聚體界面處的相互作用主要是由結(jié)構(gòu)緊密的α-螺旋相互作用。在相互結(jié)合的過程中底物結(jié)合的活性位點被很好的分離;它們并不在亞基的結(jié)合界面處,結(jié)合的二羧酸底物距離大概能達(dá)30A。在溶液環(huán)境中,蘋果酸脫氫酶的二聚體結(jié)構(gòu)對于其催化活性有很重要的意義。文獻(xiàn)中指出,亞基間的相互作用同時還包含了對底物結(jié)合位點的穩(wěn)定及定位作用。

 齊岳生物供應(yīng)產(chǎn)品:

HRP標(biāo)記羊抗兔IgG    

HRP標(biāo)記羊抗小鼠IgG    

生長素釋放肽合成激動劑(GHRP-2metabolite 1)    

辣根過氧化物酶    

DAB (HRP顯色底物)    

HRP酶穩(wěn)定劑    

兔抗馬IgG-HRP    

兔抗雞IgG一HRP    

兔抗牛IgG一HRP    

羊抗雞IgG一HRP    

羊抗馬IgG-HRP    

羊抗豬IgG一HRP    

羊抗大鼠IgG一HRP    

羊抗小鼠IgG-HRP    

羊抗兔IgG一HRP    

羊抗人IgG一HRP    

兔抗狗IgG-HRP    

兔抗豚鼠IgG-HRP    

兔抗猴IgG-HRP    

HRP標(biāo)記前列腺特異性抗原(HRP-PSA)多肽    

HRP標(biāo)記水通道蛋白12(HRP-AQP12)多肽    

HRP標(biāo)記水通道蛋白6(HRP-AQP6)多肽    

HRP標(biāo)記咧美辛    

HRP標(biāo)記微囊藻毒素RR(MC-RR-HRP)    

HRP標(biāo)記微囊藻毒素LR(MC-LR-HRP)    

HRP標(biāo)記雌三醇(E3-HRP)    

HRP標(biāo)記氰戊菊酯    

HRP標(biāo)記新霉素    

HRP標(biāo)記前列腺素E2(PGE2-HRP)    

HRP標(biāo)記前列腺素E1(PGE1-HRP)    

HRP標(biāo)記前列腺素A2(PGA2-OVA)    

HRP標(biāo)記氯磺隆(CSH-HRP)    

HRP標(biāo)記膽固醇(Cholesterol-HRP)    

HRP標(biāo)記地塞米松(Dexamethasone-HRP)    

HRP標(biāo)記氫化可的松(Hydrocortisone-HRP)    

HRP標(biāo)記雌二醇(Estradio1-HRP)    

HRP標(biāo)記睪啊(Testosterone-HRP)    

HRP標(biāo)記孕酮(Testosterone-HRP)    

HRP標(biāo)記維生素E(VE-HRP)    

HRP標(biāo)記維生素B6(VB6-HRP)    

HRP標(biāo)記維生素A(VA-HRP)    

HRP標(biāo)記膽鈣化醇(VD3-HRP)    

HRP標(biāo)記維生素D2(VD2-HRP)    

HRP標(biāo)記維生素B3(VB3-HRP)    

HRP標(biāo)記黃素單核首酸(FMN一HRP)    

HRP標(biāo)記維生素B2(VB2-HRP)    

HRP標(biāo)記苯并菲(Chrysene-HRP)    

HRP標(biāo)記蘇(Fluorene-HRP)    

HRP標(biāo)記石杉堿甲(Huperzine-HRP)    

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